Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn1P35821 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms