Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF1P09603 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF1P09603 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF1P09603 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms