Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01661 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01661 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01661 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01661 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms