Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccl20O89093 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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