Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc175E9PVB3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms