Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm436B1AVU6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm436B1AVU6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms