Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shisal2aA2A9G7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shisal2aA2A9G7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms