Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZK6

Anks3, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks3Q9CZK6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Anks3Q9CZK6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms