Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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