Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CWU4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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