Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pfdn1Q9CWM4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pfdn1Q9CWM4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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