Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Chmp3Q9CQ10 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp3Q9CQ10 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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