Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms