Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A2Q96QD8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms