Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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