Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20809Q62458 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms