Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3V0E1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3V0E1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms