Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms