Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csrnp3P59055 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csrnp3P59055 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csrnp3P59055 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csrnp3P59055 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csrnp3P59055 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrnp3P59055 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms