Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms