Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms