Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms