Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prss29Q99MS4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms