Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms