Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OPALINQ96PE5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms