Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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