Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACBD4Q8NC06 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms