Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp37Q8C0R0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp37Q8C0R0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp37Q8C0R0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp37Q8C0R0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp37Q8C0R0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms