Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RFPL4BQ6ZWI9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RFPL4BQ6ZWI9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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