Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sprr1bQ62267 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms