Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf116Q5BN46 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms