Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms