Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTPN13Q12923 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PTPN13Q12923 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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PTPN13Q12923 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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