Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnma1Q08460 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms