Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
NrepQ07475 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms