Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms