Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms