Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms