Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms