Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Surf1P09925 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Surf1P09925 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms