Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms