Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crlf3Q9Z2L7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crlf3Q9Z2L7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Crlf3Q9Z2L7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms