Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K7

Apc2, Adenomatous polyposis coli protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apc2Q9Z1K7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apc2Q9Z1K7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Apc2Q9Z1K7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apc2Q9Z1K7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apc2Q9Z1K7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apc2Q9Z1K7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apc2Q9Z1K7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apc2Q9Z1K7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms