Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema4fQ9Z123 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema4fQ9Z123 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4fQ9Z123 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms