Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cldn3Q9Z0G9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn3Q9Z0G9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn3Q9Z0G9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn3Q9Z0G9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms