Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PapolbQ9WVP6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PapolbQ9WVP6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms