Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcn5Q9WVD4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcn5Q9WVD4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn5Q9WVD4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn5Q9WVD4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms