Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap4b1Q9WV76 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap4b1Q9WV76 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap4b1Q9WV76 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms