Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Scnn1bQ9WU38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scnn1bQ9WU38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scnn1bQ9WU38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scnn1bQ9WU38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scnn1bQ9WU38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms