Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc26a4Q9R155 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc26a4Q9R155 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc26a4Q9R155 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc26a4Q9R155 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc26a4Q9R155 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc26a4Q9R155 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc26a4Q9R155 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 500.1 ms